4. Brain Staining Dye

실험을 하면서 brain staining을 진행할 때 사용하였던 antibody들입니다.

각각이 무슨 마커이고, brain의 어떠한 영역을 염색하는지 정리했습니다.

이 게시글은 새로운 dye를 사용할 때마다 계속해서 re-upload 할 예정입니다 :)

 

 

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[ 1st / 2nd Antibody ]

 

1. Lectin

 

 

 

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2. NF-H

: NF-H protein은 neuron에서 발견되는 10nM의 filament인

Neurofilaments(NF)를 구성하는 요소입니다.

 

NF는

1) axon에 대한 구조적인 지지,

2) axon의 직경을 조절하는 기능을 수행합니다. 

 

--> NF-H AB는 axon을 staining 합니다.

 

 

 

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3. GFAP

: GFAP protein은 astrocytes와 같은

glia cell에서의 대표적인 protein입니다. 

 

*  Glia: neuron이 아닌, 신경계에 존재하는 다른 cell type들을 총칭합니다.

 

--> GFAP AB는 glia cell type들을 staining 합니다.

 

 

 

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4. Paravalbumin

: Paravalbumin ptn은 9-11 kDA의 작은 분자량을 가진

칼슘 결합 단백질 입니다.

 

주로 신경계의 일부

GABAergic neuron

에 존재합니다. 

 

 

 

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5. Calretinin

 

 

 

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6. MAP2 / Tau

: Microtubule-associated proteins에 속하는

MAP2와 Tau는 neuron의 미세소관에서 발현됩니다. 

 

MAP2 ptn은 미세소관 및 F-actin network reconstruction에

관여하는 중요한 기능을 수행합니다.

 

외에도 microtubule stability의 조절에 중요한 기능을 수행합니다.

 

--> neuron의 microtubule을 staining 합니다. 

 

 

 

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7. CD31

 

 

 

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8. SMI312

: monoclonal antibody that recognizes a non-phosphorylated epitope

on the subunits of neurofilament proteins

 

SMI-312 AB는 neurofilament medium polymeptide를 targeting 합니다. 

 

--> neurofilament를 staining 합니다.

 

 

 

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9. NeuN

: Neun ptorein은 일반적으로 neuron의 biomarker로 사용되는

neuron nucleus antigen입니다.

 

--> NeuN AB는 neuron의 핵을 staining 합니다. 

 

 

 

 

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10. MBP(Myelin Basic Protein)

: MBP group는 PLP와 함께 CNS에서 myelin membrain의

가장 풍부한 ptn components 입니다. 

 

이들은 myelin formation과 stabilization의 기능을 수행합니다. 

 

--> myelin specific marker로서 사용됩니다. 

 

 

 

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11. GABA

: GABA는 B6를 보조인자로 사용하는 효소인

glutamate decarbozylase에 의해 presynaptic neuron에서 합성됩니다.

 

합성 후,

vesicular inhibitory amino acid transporter에 의해서

synaptic vesicle에 loading 됩니다.

 

--> GABA AB는 pre-synapse를 staining 합니다. 

 

 

 

 

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12. Connexin

 

 

 

 

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13. Synaptophysin

: synaptophysin은 pre-synaptic vesicular protein으로,

synaptic plasticity and integrity를 위한 marker로써 사용됩니다. 

 

나이가 들어감에 따라 hippocampal and cortical region에서 그 양이 감소합니다.

 

--> pre-synapse를 staining 합니다.

 

 

 

 

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14. Bassoon

: Basson은 pre-synaptic nerve terminals에 국한된 420kDa ptn으로,

시냅스 소포 cycle의

구조적, 기능적 조직의 역할을 담당하는 protein입니다. 

 

또 다른 pre-synaptic nerve protein으로는 piccolo가 있습니다. 

 

--> Bassoon AB는 pre-synapse를 staining 합니다. 

 

 

 

 

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15. Synapsin 1

: Synapsin 1은 pre-synaptic terminal에 존재하는 단백질로,

cyclic AMP-dependent protein kinase에 대한

주요 endogenous substrate 입니다.

 

synapsin 1은 신경 전달물질의 방출을 조절하는

신경 말단 분자로써 작용합니다. 

 

--> Synapsin 1 AB는 pre-synapse를 staining 합니다. 

 

 

 

 

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16. PSD95

: PSD95 protein은 excitatory neuron(흥분성 뉴런)에서

중추적인 post-synaptic scaffolding protein입니다.

 

synapse region에서 synaptic marker로써 사용됩니다.

 

--> PSD95 AB는 post-synapse를 staining 합니다.

 

 

 

 

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17. Homer1

: Homer1 protein은 synaptic scaffold protein으로,

glutamatergic synapses를 조절합니다. 

 

--> Homer1 AB는 post-synapse를 staining 합니다.

 

 

 

 

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18. c-Fos

 

 

 

 

 

 

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Neuron with neurofilaments ㅣ https://www.researchgate.net/figure/Neuron-with-neurofilaments-Figure-illustrates-disintegrating-neurofilaments-and_fig1_345167036

 

 

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Neuron structure ㅣ https://www.researchgate.net/figure/a-Structure-of-neuron-with-axon-dendrites-and-synapses-b-Structure-of-a-synaptic_fig3_278827467

 

 

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참고 사이트 및 문헌

1. The MAP2/Tau family of microtubule-associated proteins: https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/gb-2004-6-1-204

 

2. SMI-312 Antibody: https://www.citeab.com/antibodies/1898662-ab24574-anti-neurofilament-antibody-smi-312

 

3. Postsynaptic density protein 95 (PSD-95) is transported by KIF5 to dendritic regions: https://molecularbrain.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13041-019-0520-x

 

 

 

 

 

 

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